Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF554Q86TJ5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms