Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms