Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRCQ7RTU9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRCQ7RTU9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms