Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM43BQ6ZT52 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms