Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UBR3Q6ZT12 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBR3Q6ZT12 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
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