Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC00299Q6ZSB3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC00299Q6ZSB3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms