Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRIG3Q6UXM1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRIG3Q6UXM1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms