Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SHISA2Q6UWI4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms