Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC171Q6TFL3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC171Q6TFL3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms