Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KANK3Q6NY19 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KANK3Q6NY19 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms