Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RCSD1Q6JBY9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RCSD1Q6JBY9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms