Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GARNL3Q5VVW2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms