Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AGAP9Q5VTM2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms