Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C12orf60Q5U649 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C12orf60Q5U649 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C12orf60Q5U649 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C12orf60Q5U649 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.9 ms