Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C1orf220Q5T0J3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C1orf220Q5T0J3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms