Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CC2D1BQ5T0F9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CC2D1BQ5T0F9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms