Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NHSL1Q5SYE7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms