Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LDLRAP1Q5SW96 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms