Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FRMPD3Q5JV73 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FRMPD3Q5JV73 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms