Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HERC4Q5GLZ8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HERC4Q5GLZ8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms