Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL8

PDZD11, PDZ domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD11Q5EBL8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDZD11Q5EBL8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDZD11Q5EBL8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms