Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
SDK2Q58EX2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SDK2Q58EX2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms