Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDCA8Q53HL2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA8Q53HL2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms