Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC38Q502W7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC38Q502W7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms