Protein–RNA interactions for Protein: Q49A88

CCDC14, Coiled-coil domain-containing protein 14, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC14Q49A88 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC14Q49A88 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms