Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LSM12Q3MHD2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms