Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
KRTAP20-2Q3LI61 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms