Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

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Length 1,238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EDRF1Q3B7T1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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