Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL38Q2WGJ6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms