Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPEL1Q2QD12 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms