Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDO1Q16878 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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