Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PFKFB3Q16875 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PFKFB3Q16875 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms