Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UPP1Q16831 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPP1Q16831 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms