Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
FOXD1Q16676 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD1Q16676 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
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