Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF239Q16600 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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