Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNAPC1Q16533 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNAPC1Q16533 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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