Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E2F4Q16254 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E2F4Q16254 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms