Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS72Q15906 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS72Q15906 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
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