Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNA2Q15822 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA2Q15822 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA2Q15822 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
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