Protein–RNA interactions for Protein: Q15388

TOMM20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20Q15388 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TOMM20Q15388 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TOMM20Q15388 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms