Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 32.8
PCBP2Q15366 CAPN15-203ENST00000565010 1952 ntTSL 1 (best)18.47■□□□□ 0.554e-8■■■■■ 32.8
PCBP2Q15366 CAPN15-204ENST00000566977 279 ntTSL 513.01□□□□□ -0.334e-8■■■■■ 32.8
PCBP2Q15366 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.76e-43■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.096e-43■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 SIGMAR1-202ENST00000353468 1582 ntTSL 1 (best)19.57■□□□□ 0.726e-43■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 RALBP1-205ENST00000585015 945 ntTSL 322.9■■□□□ 1.261e-7■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 RALBP1-202ENST00000383432 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 RALBP1-203ENST00000458039 836 ntTSL 311.36□□□□□ -0.591e-7■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 RALBP1-201ENST00000019317 4368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 RALBP1-204ENST00000577221 503 ntTSL 38.51□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 SCAP-207ENST00000441517 3748 ntTSL 214.73□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 SCAP-202ENST00000320017 3430 ntTSL 214.15□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 SCAMP5-218ENST00000568423 1142 ntTSL 317.06■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 NR2F2-AS1-210ENST00000561344 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.654e-28■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 NR2F2-AS1-201ENST00000502125 1930 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.864e-28■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 NR2F2-AS1-203ENST00000558929 574 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.964e-28■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.274e-28■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.584e-28■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 CBFA2T2-207ENST00000471007 712 ntTSL 219.01■□□□□ 0.633e-9■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.463e-9■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 CBFA2T2-205ENST00000375279 7617 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.583e-9■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 CBFA2T2-202ENST00000344201 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.733e-9■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 CBFA2T2-206ENST00000397800 7449 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.933e-9■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.943e-9■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 CBFA2T2-209ENST00000492345 7803 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.073e-9■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.193e-7■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.682e-6■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.121e-13■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.111e-13■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.081e-13■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 MGME1-205ENST00000467391 740 ntTSL 1 (best)8.55□□□□□ -1.041e-13■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 MGME1-204ENST00000463219 571 ntTSL 38.34□□□□□ -1.071e-13■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.218e-9■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.857e-9■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.87e-8■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 TCF3-216ENST00000592395 996 ntTSL 517.69■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 TCF3-207ENST00000586164 409 ntTSL 317.14■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 TCF3-211ENST00000587425 629 ntTSL 214.01□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 TCF3-205ENST00000585731 1222 ntTSL 212.8□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 32.7
PCBP2Q15366 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.44e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.74e-10■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 SPRED2-205ENST00000440972 555 ntTSL 312.22□□□□□ -0.455e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.294e-10■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.392e-19■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 220.73■□□□□ 0.915e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.95e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 UVRAG-207ENST00000531818 3152 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 UVRAG-209ENST00000533454 1823 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 UVRAG-208ENST00000532130 1831 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 UVRAG-202ENST00000525183 1325 ntTSL 28.85□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 KPNB1-204ENST00000577875 605 ntTSL 34.89□□□□□ -1.633e-9■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 NR2F2-AS1-202ENST00000557863 515 ntTSL 315.22■□□□□ 0.034e-28■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 DOK6-201ENST00000382713 8890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 RIN2-205ENST00000467569 871 ntTSL 512.59□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 RIN2-203ENST00000459721 437 ntTSL 510.91□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 RIN2-201ENST00000255006 4505 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 RIN2-207ENST00000488077 462 ntTSL 57.67□□□□□ -1.181e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ERCC2-209ENST00000586856 690 ntTSL 522.7■■□□□ 1.228e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.188e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 INAVA-203ENST00000451872 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.1■■□□□ 1.138e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.038e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 SSBP4-205ENST00000598159 747 ntTSL 321.46■■□□□ 1.038e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.018e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 SSBP4-209ENST00000601357 606 ntTSL 521.1■□□□□ 0.978e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.958e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.938e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.938e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-214ENST00000578577 1511 ntTSL 220.65■□□□□ 0.98e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 MED25-208ENST00000599722 504 ntTSL 320.35■□□□□ 0.858e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 NAGPA-206ENST00000562746 2260 ntTSL 220.22■□□□□ 0.838e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.818e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.778e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 NAGPA-207ENST00000563578 1494 ntTSL 319.85■□□□□ 0.778e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ERCC2-212ENST00000591309 557 ntTSL 419.6■□□□□ 0.738e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.738e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.78e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 ERCC2-206ENST00000586131 1007 ntTSL 319.39■□□□□ 0.698e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.668e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.668e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.668e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 INAVA-207ENST00000532631 570 ntTSL 318.93■□□□□ 0.628e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 CALM1-207ENST00000553964 2670 ntTSL 1 (best)18.91■□□□□ 0.621e-7■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 MAP2K2-203ENST00000593364 872 ntTSL 518.85■□□□□ 0.618e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 MAP2K2-210ENST00000601786 1778 ntTSL 218.84■□□□□ 0.618e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 NAGPA-213ENST00000568202 1843 ntTSL 518.8■□□□□ 0.68e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 NAGPA-205ENST00000562346 570 ntTSL 418.8■□□□□ 0.68e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.68e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.598e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.598e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 NECAB3-217ENST00000606106 591 ntTSL 418.53■□□□□ 0.568e-8■■■■■ 32.6
PCBP2Q15366 PLD5-206ENST00000467561 1353 ntTSL 518.3■□□□□ 0.528e-8■■■■■ 32.6
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