Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTF1Q15361 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTF1Q15361 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
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