Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRRQ15256 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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PTPRRQ15256 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRRQ15256 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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