Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NECTIN1Q15223 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NECTIN1Q15223 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms