Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAM2Q15035 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAM2Q15035 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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