Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HERPUD1Q15011 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HERPUD1Q15011 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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