Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GINS1Q14691 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GINS1Q14691 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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