Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM29Q14134 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM29Q14134 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
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