Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA1SQ13698 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1SQ13698 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
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