Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MTMR3Q13615 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MTMR3Q13615 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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